Рецептор ліпопротеїнів дуже низької щільності

Рецептор ліпопротеїнів дуже низької щільності
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1V9U, 3DPR
Ідентифікатори
Символи	VLDLR, CAMRQ1, CARMQ1, CHRMQ1, VLDLRCH, VLDL-R, very low density lipoprotein receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 192977 MGI: 98935 HomoloGene: 443 GeneCards: VLDLR
Пов'язані генетичні захворювання
cerebellar ataxia, mental retardation, and dysequilibrium syndrome 1[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • low-density lipoprotein particle receptor activity • reelin receptor activity • calcium ion binding • apolipoprotein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • very-low-density lipoprotein particle binding • calcium-dependent protein binding • very-low-density lipoprotein particle receptor activity • cargo receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • receptor complex • клітинна мембрана • very-low-density lipoprotein particle • clathrin-coated pit • міжклітинний простір • lysosomal membrane Біологічний процес • steroid metabolic process • lipid transport • ендоцитоз • dendrite morphogenesis • lipid metabolism • glycoprotein transport • cholesterol metabolic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • пам'ять • positive regulation of dendrite development • рецептор-опосередкований ендоцитоз • нейробіологія розвитку • ventral spinal cord development • reelin-mediated signaling pathway • GO:0015915 транспорт • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of protein kinase activity • axon guidance • low-density lipoprotein particle receptor catabolic process • very-low-density lipoprotein particle clearance Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7436	22359
Ensembl	ENSG00000147852	ENSMUSG00000024924
UniProt	P98155	P98156
RefSeq (мРНК)	NM_001018056 NM_003383 NM_001322225 NM_001322226	NM_001161420 NM_013703 NM_001347441
RefSeq (білок)	NP_001018066 NP_001309154 NP_001309155 NP_003374	NP_001154892 NP_001334370 NP_038731
Локус (UCSC)	Хр. 9: 2.62 – 2.66 Mb	Хр. 19: 27.22 – 27.25 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Рецептор ліпопротеїнів дуже низької щільності (ЛПДНЩ-рецептор;англ. Very low density lipoprotein receptor, VLDLR) – білок, який кодується геном VLDLR, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 873 амінокислот, а молекулярна маса — 96 098[5]. За структурою схожий із рецептором ліпопротеїнів низької щільності, але не здатний зв'язувати ліпопротеїни низької щільності. Рецептор ЛПДНЩ відіграє роль в метаболізмі ліпопротеїнів дуже низької щільності. Експресія ЛПДНЩ-рецептору висока в серці, скелетних м'язах, жировій тканині; ЛПДНЩ-рецептор спільно з рецептором ЛНЩ зв'язує і захоплює залишкові ліпопротеїни: ліпопротеїни проміжної щільності і хіломікронні ремнанти[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGTSALWALW		LLLALCWAPR		ESGATGTGRK		AKCEPSQFQC		TNGRCITLLW
KCDGDEDCVD		GSDEKNCVKK		TCAESDFVCN		NGQCVPSRWK		CDGDPDCEDG
SDESPEQCHM		RTCRIHEISC		GAHSTQCIPV		SWRCDGENDC		DSGEDEENCG
NITCSPDEFT		CSSGRCISRN		FVCNGQDDCS		DGSDELDCAP		PTCGAHEFQC
STSSCIPISW		VCDDDADCSD		QSDESLEQCG		RQPVIHTKCP		ASEIQCGSGE
CIHKKWRCDG		DPDCKDGSDE		VNCPSRTCRP		DQFECEDGSC		IHGSRQCNGI
RDCVDGSDEV		NCKNVNQCLG		PGKFKCRSGE		CIDISKVCNQ		EQDCRDWSDE
PLKECHINEC		LVNNGGCSHI		CKDLVIGYEC		DCAAGFELID		RKTCGDIDEC
QNPGICSQIC		INLKGGYKCE		CSRGYQMDLA		TGVCKAVGKE		PSLIFTNRRD
IRKIGLERKE		YIQLVEQLRN		TVALDADIAA		QKLFWADLSQ		KAIFSASIDD
KVGRHVKMID		NVYNPAAIAV		DWVYKTIYWT		DAASKTISVA		TLDGTKRKFL
FNSDLREPAS		IAVDPLSGFV		YWSDWGEPAK		IEKAGMNGFD		RRPLVTADIQ
WPNGITLDLI		KSRLYWLDSK		LHMLSSVDLN		GQDRRIVLKS		LEFLAHPLAL
TIFEDRVYWI		DGENEAVYGA		NKFTGSELAT		LVNNLNDAQD		IIVYHELVQP
SGKNWCEEDM		ENGGCEYLCL		PAPQINDHSP		KYTCSCPSGY		NVEENGRDCQ
STATTVTYSE		TKDTNTTEIS		ATSGLVPGGI		NVTTAVSEVS		VPPKGTSAAW
AILPLLLLVM		AAVGGYLMWR		NWQHKNMKSM		NFDNPVYLKT		TEEDLSIDIG
RHSASVGHTY		PAISVVSTDD		DLA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани.

Див. також

• Хромосома 9

Література

• Webb J.C., Patel D.D., Jones M.D., Knight B.L., Soutar A.K. (1994). Characterization and tissue-specific expression of the human 'very low density lipoprotein (VLDL) receptor' mRNA. Hum. Mol. Genet. 3: 531—537. PMID 8069294 DOI:10.1093/hmg/3.4.531
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Neumann E., Moser R., Snyers L., Blaas D., Hewat E.A. (2003). A cellular receptor of human rhinovirus type 2, the very-low-density lipoprotein receptor, binds to two neighboring proteins of the viral capsid. J. Virol. 77: 8504—8511. PMID 12857919 DOI:10.1128/JVI.77.15.8504-8511.2003
• Verdaguer N., Fita I., Reithmayer M., Moser R., Blaas D. (2004). X-ray structure of a minor group human rhinovirus bound to a fragment of its cellular receptor protein. Nat. Struct. Mol. Biol. 11: 429—434. PMID 15064754 DOI:10.1038/nsmb753

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з Рецептор ліпопротеїнів дуже низької щільності переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12698 (англ.) . Архів оригіналу за 2 травня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.
5. UniProt, P98155 (англ.) . Процитовано 26 квітня 2018.
6. Takahashi S, Sakai J, Fujino T, Hattori H, Zenimaru Y, Suzuki J, Miyamori I, Yamamoto TT (2004). The very low-density lipoprotein (VLDL) receptor: characterization and functions as a peripheral lipoprotein receptor. J. Atheroscler. Thromb. 11 (4): 200—8. PMID 15356379.

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»