Аполіпоротеїн B (англ.Apolipoprotein B) – білок, який кодується геном APOB, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 563 амінокислот, а молекулярна маса — 515 605[5].
Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм ліпідів, транспорт, метаболізм холестеролу, транспорт ліпідів, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів.
Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину.
Локалізований у цитоплазмі.
Також секретований назовні.
Білкові ізоформи
Основний білок, який утворюється при експресії гену APOB має молекулярну масу близько 100 кДа, синтезується в печінці й відповідає за обмін ліпідів, перебуваючи у складі ліпопротеїдів великої і низької щільності в плазмі крові. Механізм редагування мРНК аполіпопротеїну B призводить до появи меншої ізоформи ApoB-48 (масою 48 кДа), яка секретується клітинами тонкого кишечнику.
Історія відкриття
Група американських вчених із Техасу досліджувала як саме один ген дає дві різні білкові ізоформи[6]. Перша ізоформа за амінокислотною послідовністю збігалася з теоретично передбаченою з нуклеотидів гену APOB, тоді як ApoB-48 хоча й мала антигенні властивості N-кінцевої ділянки першої, проте значно відрізнялася за функцією. Аналіз мРНК у печінці й кишечнику виявив наявність повних транскриптів гену ApoB, але в кишечнику цитозин у 6457 положенні було замінено на урацил. Така заміна в цьому місці перетворювала кодон ЦАА, що кодує амінокислоту глутамін, на триплет УАА, що є одним зі стоп-кодонів. Це призводило до припинення трансляції білку й утворення вкороченої молекули ApoB-48. Автори дослідження висунули гіпотезу про відкриття унікального механізму зміни транскрипції. У подальшому було описано цілу систему дезамінування цитозинів у мРНК після транскрипції.
Механізм редагування РНК
Головним ферментом, який бере участь у редагуванні РНК шляхом дезамінування цитидину, в хребетних тварин є цитидиндезаміназа, яка кодується геном APOBEC1. Цей фермент редагує вже зрілі мРНК в ядрі. Для редагування необхідний білковий комплекс, до якого окрім APOBEC1 входить білок ACF (англ.apobec-1 complementation factor), допоміжний фактор APOBEC1 і ще деякі білки. Цей комплекс розпізнає ділянку РНК у 30-40 нуклеотидів, яка утворює шпильку, причому цільовий цитозин міститься в «голівці» (неспареній ділянці) цієї шпильки. Білок ACF виконує адапторну функцію, забезпечуючи контакт дезамінази з РНК. Комплекс розпізнає послідовність UUUN(A/U)U, яка має міститися далі за сайтом редагування та перетинається з якірною послідовністю, до якої приєднується молекула ACF.
мРНК аполіпопротеїну B є основною мішенню дії ферменту APOBEC1, який експресується переважно у кишечнику людини та додатково у печінці інших видів ссавців.
Література
Deeb S.S., Motulsky A.G., Albers J.J. (1985). A partial cDNA clone for human apolipoprotein B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 82: 4983—4986. PMID3860836DOI:10.1073/pnas.82.15.4983
Hardman D.A., Protter A.A., Schilling J.W., Kane J.P. (1987). Carboxyl terminal analysis of human B-48 protein confirms the novel mechanism proposed for chain termination. Biochem. Biophys. Res. Commun. 149: 1214—1219. PMID3426612DOI:10.1016/0006-291X(87)90537-7
Hospattankar A.V., Higuchi K., Law S.W., Meglin N., Brewer H.B. Jr. (1987). Identification of a novel in-frame translational stop codon in human intestine apoB mRNA. Biochem. Biophys. Res. Commun. 148: 279—285. PMID2445342DOI:10.1016/0006-291X(87)91107-7
Dashti N., Lee D.M., Mok T. (1986). Apolipoprotein B is a calcium binding protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 137: 493—499. PMID3087360DOI:10.1016/0006-291X(86)91237-4
Zhao Y., McCabe J.B., Vance J., Berthiaume L.G. (2000). Palmitoylation of apolipoprotein B is required for proper intracellular sorting and transport of cholesteroyl esters and triglycerides. Mol. Biol. Cell. 11: 721—734. PMID10679026DOI:10.1091/mbc.11.2.721
