Вирус был обнаружен в 1996 году в тканях грызунов, пойманных на территории Хабаровского края. Было проведено сравнительное исследование с другими образцами РНК вирусов и определено родство с хантавирусами. Во время генетического сравнения было показано, что вирус Хабаровск занимает промежуточное положение между Prospect Hill orthohantavirus и вирусом Пуумала[4]. В 2017 году в связи с выделением порядка Bunyavirales и ревизией рода Hantavirus название вида изменено, как и у большинства других относящихся к порядку таксонов[3].
