Деревня Паньшино расположена среди лесов примерно в 9 км к северу от города Коломны. В километре к юго-западу от деревни проходит автодорога Р115. В 2 км восточнее деревни находится платформа Конев Бор Рязанского направления Московской железной дороги. Ближайшие населённые пункты — деревня Рождественка и посёлок городского типа Пески. В лесах южнее деревни Паньшино протекает река Велегушка.