17 мая 1894 года открылось регулярное движение поездов на участке Минеральные Воды — Кисловодск[1]. По другим данным, 14 мая 1893 года прибыл первый поезд до станции Ессентуки на железнодорожной ветке Минеральные Воды — Кисловодск. 6 августа поезда стали регулярно ходить уже до конечной станции «Кисловодск»[2].
Электрифицирована вместе со всей веткой, в 1936 году на постоянном токе 1,5 кВ. В 1964 году переведена на напряжение 3 кВ, в 2006 году переведена на переменный ток 25 кВ.
10 июля 1944 года восстановлено бесперебойное железнодорожное сообщение между Минераловодской узловой станцией и курортными городами Кавминвод[3].
5 декабря 2003 года во втором вагоне пригородного электропоезда Кисловодск — Минеральные Воды в 7:42 (по московскому времени) при подъезде к железнодорожному вокзалу станции произошёл взрыв, в результате которого 36 человек погибли, ранения получили 155. Взрывное устройство сработало когда до остановки электропоезда оставалось 400 метров. Со слов очевидцев, две женщины внесли в вагон большую сумку и за несколько минут до взрыва выпрыгнули из вагона.
Бомба была взорвана дистанционно. Тела пострадавших вытаскивали из взорванного вагона, который после взрыва завалился на бок. По сообщению представителя МЧС РФ ещё 7 человек оказались зажатыми внутри искорёженного вагона, но спасатели к ним не успели — 6 человек скончались, а 1 доставили в больницу в крайне тяжёлом состоянии. На месте происшествия работали 16 бригад скорой помощи, спасатели из Кисловодска и Ставрополя, пострадавших доставляли в больницы Ессентуков и Предгорного района.
Взрыв в электропоезде пришёлся на то время, когда в нём ехало большое количество людей на работу и учёбу. Он был настолько мощным, что вагон разорвало на две части. По предварительной оценки мощность его составляла до 10 кг в тротиловом эквиваленте. Взрывное устройство было начинено болтами и гайками. Сразу после взрыва в вагоне вспыхнул пожар. Возбуждено уголовное дело по двум статьям УК РФ — 205 (терроризм) и 105 ч.2 (умышленное убийство двух и более лиц).
Эта происшествие стало вторым после взрыва этого же самого пригородного электропоезда, случившегося 3 октября 2003 года вблизи станции Подкумок.