Драфт ВНБА 2006 года прошёл 5 апреля, в среду, в выставочном центре (англ.Boston Convention and Exhibition Center) города Бостон, штат Массачусетс, который стал первым драфтом женской НБА, проводившимся за пределами штата Нью-Джерси. К участию в драфте были допущены игроки после окончания колледжа и игроки-иностранцы. Лотерея драфта состоялась 24 октября2005 года, по её результатам право выбора под первым номером получила команда «Миннесота Линкс»[1], который она использовала на 21-летнюю Сеймон Огастус, защитника из университета штата Луизиана[2]. Кроме того сама церемония драфта состоялась на следующий день после проведения финала женской NCAA («Мэриленд Террапинс» — «Дьюк Блю Девилз» 78:75 ОТ), который также был сыгран в Бостоне на арене ТД Бэнкнорт-гарден.
В сезоне 2006 года приняло участие 14 клубов, на один больше, чем в прошедшем, потому что в межсезонье ВНБА пополнила команда «Чикаго Скай». В результате увеличения количества команд ассоциации состоялся так называемый драфт расширения, который прошёл 16 ноября2005 года. Первый раунд драфта транслировался на канале ESPN2, в то время как второй и третий раунды были показаны на кабельных каналах NBA TV и ESPNU, а телевизионную трансляцию драфта комментировала Линда Кон.