В 1870 году эти территории вошли в состав новой канадской Конфедерации. Часть территорий отошли Онтарио и Квебеку. В 1870 году из Северо-Западных территорий была выделена провинция Манитоба, в 1898 году — Юкон, в 1905 — провинции Альберта и Саскачеван. В 1912 году границы Северо-Западных территорий были установлены и оставались неизменными вплоть до 1999 года, когда на севере территорий был образован Нунавут. С 1920 до 1999 года Северо-Западные территории были поделены на три района: Франклин, Киватин и Маккензи.
С тех пор как в 1982 году был принят новый конституционный акт, ряд представителей коренных народов Крайнего Севера инициировали судебные разбирательства по поводу земельных претензий. В 1992 году жители Северо-Западных территорий проголосовали за то, чтобы разделить территорию по национальному признаку — эскимосы проживали преимущественно на востоке, а дене — на западе. 1 апреля1999 года была выделена новая территория — Нунавут, населённая эскимосами.
Коммуникации и путешествия
Часто на этих территориях возникают проблемы со связью и транспортом. Долгие зимы приводят к тому, что реки судоходны только в течение двух месяцев. Проложена железная дорога, длиной почти 1000 км, достаточно развита шоссейная система, связывающая территории с провинцией Альберта и Большим Невольничьим озером.. В состав региона входят десятки аэродромов. В 1966 году был запущен проект по строительству дорог. Шоссе Лиард, открытое в 1984 году соединяет Форт-Симпсон с Аляскинской трассой. Зимой в качестве «дорог» используются замёрзшие реки и озёра.
Вести сельское хозяйство на Северо-Западных территориях практически невозможно, за исключением территории к югу от реки Маккензи. Регион занимает второе место в Канаде по добыче полезных ископаемых. На Северо-Западных территориях добывается нефть, медные руды, алмазы, золото, вольфрам, серебро, кадмий и никель.