В 1856 году в городе Ванне была открыта товарная станция железнодорожного участка Кёльн-Минден. В 1864 году был открыт пассажирский вокзал. Первоначально вокзал получил имя Ванне. В 1913 году здание вокзала было перестроено и расширено.
1 апреля1926 года города Ванне и Айккель были объединены, вследствие чего вокзал получает имя новообразованного города Ванне-Айкель. Это имя осталось неизменным и после 1 января1975 года, когда город Ванне-Айккель вошёл в состав Херне. В 1930-е годы станция Ванне-Айккель становится самой крупной сортировочной станцией в Рурской области. В это время к станции было приписано более 300 локомотивов.
В настоящее время вокзал Ванне-Айккель остаётся важным железнодорожным узлом на пересечении участков Дортмунд-Дуйсбург и Мюнстер-Бохум, а также является конечным пунктом участка Ванне-Айккель-Гамбург. В 2003 годуDeutsche Bahn AG планировало переименовать вокзал Ванне-Айккель в главный вокзал Херне (нем.Herne Hauptbahnhof), но этим планам не суждено было осуществиться из-за массового протеста жителей района Ванне-Айккель.