Основан в 1762 году. Считается, что основателем поселка был сбежавший с Урала каторжанин Чугуев. Переселенцы из Казанской, Рязанской, Орловской, Тамбовской губерний. «Чалдоны» составляли большую часть населения Верх-Чебулы.
Согласно же научному обоснованию названия, слово «чебула» в переводе с тюркского языка означает «длинная река». Существует мнение, что сначала так назвали реку, а уже после возникло поселение на её берегу.