Tussen 1549 en 1551 was ze de minnares van Hendrik II. Jane werd het middelpunt van politieke intriges, en al snel werd ze van het hof verdreven door Diane de Poitiers, de andere maîtresse, en Catharina de' Medici, de vrouw van de koning. De eerste bewerkstelligde ook dat ze werd teruggestuurd naar Schotland.
Uit de kortstondige relatie werd een kind geboren: