Het Formule 3000-seizoen van 1999 was het 15de FIA Formula 3000 International Championship seizoen, en startte op 1 mei 1999. Er werden tien races gehouden, voor het eerst als voorprogramma van de Formule 1.
Kalender
De puntenverdeling per race: 10 punten voor de winnaar, 6 voor de tweede, 4 voor de derde, 3 voor de vierde, 2 voor de vijfde en 1 voor de zesde.