Na de tweede staatsgreep van Mobutu in 1965 benoemde de nieuwe president, Joseph-Désiré Mobutu, hem tot residentiële minister van het land naar België en de Europese Economische Gemeenschap in 1967. Hij bekleedde verschillende belangrijke uitvoerende functies door de jaren heen, waaronder minister van Nationale Opvoeding, lid van het uitvoerend comité van de Movement Populaire de la Révolution, en minister van Hoger Onderwijs, voordat hij werd afgezet en gevangengezet. Hij koos ervoor om in ballingschap te gaan naar België in 1980, waar hij verbleef tot 1985. Mungul Diaka was Premier van Zaïre van 1 november 1991 tot 25 november 1991, benoemd door Mobutu Sese Seko, en werd beschouwd als een gematigde. Hij diende ook als gouverneur van Kinshasa van 1992 tot 1996. Mungul Diaka was getrouwd met Nelly Kamashi Mungul Diaka Lumana (1946–2022), een importeur van Nederlandse waxstoffen.