La portata dello Strona risente in modo particolare delle precipitazioni; difatti, nelle stagioni estive (specie nel tardo agosto) il torrente si secca già dal Santuario di Boca; ma la portata aumenta grazie agli apporti di Strego e Remme che hanno un regime ed una portata più regolare. Fattore molto importante di questa diminuzione lo rivestono anche i numerosi prelievi irrigui e idropotabili, che impoveriscono lo Strona e anche la falda sottostante.
Ma dalla confluenza con la Mora le cose cambiano; da quel punto lo Strona presenta una portata molto elevata grazie all'unione con la roggia stessa; trattiamo di valori medi di 7 m³/s con massime in stagione irrigua superiori ai 30 m³/s, dando un apporto importantissimo per il torrente Agogna.
Qualità delle acque
Non attraversando centri di particolare rilievo lo Strona ha una qualità buona delle acque; però la situazione peggiora nel basso corso. La portata del torrente è bassa e quindi lo stesso ha una capacità depurativa assai limitata e quindi questo fattore contribuisce negativamente allo stato ambientale. L'acqua migliora notevolmente alla confluenza della Mora grazie all'acqua del Sesia che è molto limpida e pulita.[3]