La Saalijalgpalli Meistriliiga 2008-2009 è stato il terzo campionato estone di calcio a 5, svoltosi nella stagione 2008-09 per la seconda volta con la formula del girone unico all'italiana. La vittoria finale è andata alla formazione del Sillamäe Kalev che ha preceduto i capitolini del Tallinna FC Ararat.
Classifica finale
Meistriliiga
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