Era la primogenita di sir Anthony Cooke, unico figlio di John Cooke e di Alice Saunders, e di sua moglie, Anne Fitzwilliam, figlia di sir William Fitzwilliam, sceriffo di Londra, e della sua prima moglie, Anne Hawes, la figlia di sir John Hawes.
Studiò latino e greco, dove si appassionò alla traduzione.
Matrimonio
Sposò, il 21 dicembre 1545, William Cecil, I barone Burghley, diventandone la seconda moglie. Ebbero sei figli, ma solo tre raggiunsero l'età adulta.