Autore di numerose opere, apprezzatissimo ritrattista, rimase sempre appartato dall'evoluzione della pittura nel corso degli anni, rimanendo fedele alla sua concezione accademica dell'arte. Nel 1889 fu eletto membro dell'Académie des beaux-arts. A Parigi, il suo atelier è stato ricostruito nel Museo Jean-Jacques Henner, dedicato alla sua opera e a quella di Édouard Louis Dubufe (1853-1909). Il pittore Many Benner, suo allievo, è stato il primo conservatore.
Un suo ritratto è stato dipinto da Jean Benner, pittore alsaziano, che era un suo amico.
Alcune opere
Paul Henner à la médaille, 1865. (Musée Jean-Jacques Henner)
La chaste Suzanne, 1865. (Musée d'Orsay)
La Biblis changée en Source, 1867. (Musée des Beaux-Arts di Digione)
La Femme au parapluie, 1874. (Musée Jean-Jacques Henner)
Il risveglio del bambino Musée des Beaux-Arts, Digione.
Gesù nella tomba Musée d'Orsay, Parigi.
Bibliografia
(FR) J.J. Henner. La Jeunesse d'un peintre. De 1847 à 1864: Du Sundgau à la Villa Médicis, Musée des Beaux-Arts de Mulhouse, éditions du Rhin, 1989. ISBN 2863390597
(FR) Face à l'impressionnisme, Jean-Jacques Henner, le dernier des romantiques, Parigi 2007.