La Copa México 1963-1964 è stata la quarantottesima edizione del secondo torneo calcistico messicano e la ventunesima nell'era professionistica del calcio messicano. È cominciata il 22 febbraio e si è conclusa il 21 aprile 1964. La vittoria finale è stata dell'América.
Formula
Le 30 squadre partecipanti si affrontano in turni ad eliminazione diretta (con gare di andata e ritorno i primi quattro turni, in gara unica la finale).
Sedicesimi di finale
Il Club de Fútbol Atlas e il Club America passano il turno senza giocare.