Questa pagina raccoglie i dati riguardanti il Calcio Padova nelle competizioni ufficiali della stagione 1999-2000.
La squadra biancoscudata si è piazzata sesta nel campionato di Serie C2 e raggiunti i quarti di finale di Coppa Italia Serie C.
Capocannoniere in campionato è stato Silvio Dellagiovanna con 7 reti. A seguire Gasparetto con 6, Ferrigno e Riccardo con 4 reti, Bonavina, De Zerbi, Ticli con 3 reti, Cartini, Galletti, Rosa con 2 reti e Sanna con 1.