Figlio di Pietro Martire e di Anna Maria Girola, si trasferisce in giovanissima età a Roma presso la bottega dello scultore Ercole Antonio Raggi; nel 1683 lavora alla decorazione del castello di Hohenaschau ad Aschau im Chiemgau, sul lago Chimsee in Alta Baviera.
Mariusz Karpowicz, Baldasar Fontana 1661-1733. Un Berniniano ticinese in Moravia e Polonia, Lugano 1990; Idem, Fontana, Baldassarre, in Dizionario Biografico degli Italiani, Roma, 619-623.
Mariusz Karpowicz, Baldassarre Fontana di Chiasso. Un artista ticinese ambasciatore dei concetti berniniani a Nord delle Alpi, in Giorgio Mollisi (a cura di), Arte&Storia, Svizzeri a Roma nella storia, nell'arte, nella cultura, nell'economia dal Cinquecento ad oggi, Edizioni Ticino Management, anno 8, numero 35, settembre-ottobre 2007, Lugano 2007, 192-197.