Au pied du pont, le long du quai de la Fosse a été installé à l'été 2009 un nouveau ponton d'une cinquantaine de mètres destiné à accueillir les bateaux de plaisance. À ce nouveau ponton s'ajoute la plate-forme d'accostage du trois-mâts barque nantais Belem, qui auparavant accostait en aval.
Le pont Anne-de-Bretagne dispose de deux voies destinées aux véhicules ainsi que de deux larges pistes cyclables et de deux trottoirs. Il est un élément essentiel dans le schéma des déplacements entre le nord et le sud de la ville. Il permet de relier le centre-ville à l'ouest de l'Île de Nantes, où émergent de nouveaux quartiers et de nouvelles activités culturelles (parc des Chantiers, Machines de l'île, Hangar à bananes, quartier de la Création…).
Le pont Anne de Bretagne accueillera d'ici 2027 les futures lignes du tramway 6 et 7[1] (l'option Busway a été abandonnée[2]).
Dans le cadre d'une amélioration des franchissements de la Loire à cet endroit, plusieurs scénarios ont été envisagés tel que le doublement du pont afin d'accueillir les futures lignes de tramway[3], ainsi que la construction d'un pont transbordeur conçu par l'architecte Paul Poirier et l’ingénieur Michel Virlogeux en aval de celui-ci[4].
Cependant, en , les premières réflexions semblent envisager la construction d'un ouvrage deux fois plus large et entièrement plane en remplacement du pont actuel, une sorte d'esplanade posée sur le fleuve permettant la circulation en parallèle des tramways, des voitures, des vélos et des piétons, à l'instar du projet de pont Simone-Veil à Bordeaux. Les piliers de l'ancien pont pourrait cependant être réutilisés pour supporter la nouvelle structure[5],[6].