PTPN22

PTPN22
Structure de la protéine PTPN22. Basé sur l'identifiant PDB 2p6x.
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 2P6X, 2QCJ, 2QCT, 3BRH, 3H2X, 3OLR, 3OMH, 4J51
Identifiants
Aliases	PTPN22, Protein tyrosine phosphatase, non receptor type 22
IDs externes	OMIM: 600716 MGI: 107170 HomoloGene: 7498 GeneCards: PTPN22
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 1 humain[1] Locus 1p13.2 Début 113,813,811 bp[1] Fin 113,871,753 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 3 (souris)[2] Locus 3|3 F2.2 Début 103,767,111 bp[2] Fin 103,819,563 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans cellule de la moelle osseuse monocyte granulocyte buccal mucosa cell sang tendon calcanéen artère temporale superficielle ganglion lymphatique epithelium of nasopharynx rate Fortement exprimé dans thymus rate granulocyte ganglion lymphatique ganglion mésentérique zygote sang secondary oocyte primary oocyte morula Plus de données d'expression de référence BioGPS Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology Fonction moléculaire phosphoprotein phosphatase activity SH3 domain binding phosphatase activity liaison de kinase liaison protéique activité hydrolase ubiquitin protein ligase binding protein tyrosine phosphatase activity Composant cellulaire cytoplasme perinuclear region of cytoplasm cytoplasmic side of plasma membrane noyau cytosol Processus biologique positive regulation of protein K63-linked ubiquitination regulation of NIK/NF-kappaB signaling regulation of innate immune response regulation of natural killer cell proliferation positive regulation of toll-like receptor 3 signaling pathway regulation of T cell receptor signaling pathway regulation of B cell receptor signaling pathway phosphoanandamide dephosphorylation processus du système immunitaire negative regulation of nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway negative regulation of p38MAPK cascade protein dephosphorylation negative regulation of gene expression negative regulation of T cell receptor signaling pathway cellular response to muramyl dipeptide autophagie response to lipopolysaccharide T cell differentiation positive regulation of gene expression positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade positive regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway negative regulation of tumor necrosis factor production negative regulation of autophagy negative regulation of JUN kinase activity negative regulation of T cell activation positive regulation of type I interferon production lipopolysaccharide-mediated signaling pathway dephosphorylation peptidyl-tyrosine dephosphorylation T cell receptor signaling pathway Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 26191 19260 Ensembl ENSG00000134242 ENSMUSG00000027843 UniProt Q9Y2R2 P29352 RefSeq (mRNA) NM_001193431 NM_001308297 NM_012411 NM_015967 NM_008979 RefSeq (protéine) NP_001180360 NP_001295226 NP_036543 NP_057051 NP_033005 Localisation (UCSC) Chr 1: 113.81 – 113.87 Mb Chr 3: 103.77 – 103.82 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
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PTPN22 pour « Protein tyrosine phosphatase, non receptor type 22 », est une protéine tyrosine phosphatase (LYP) exprimée dans les tissus lymphoïdes et codée par le gène PTPN22[5] situé sur le chromosome 1 humain.

Le gène PTPN22

PTPN22 est un gène de 57 949 paires de bases situé sur le chromosome 1 en position 1p13.2 et composé de 21 exons[6]. Il est exprimé dans les tissus lymphoïdes et code quatre isoformes traduites de manière indépendante à la suite d'un épissage alternatif[6],[7]. LYP1, l'isoforme la plus documentée, est une protéine de 807 acides aminés ayant un poids moléculaire de 105 kD. Elle est composée de 3 domaines majeurs. Un domaine catalytique tyrosine phosphatase (PTP)en N-terminal, un domaine intermédiaire et un domaine C-terminal composé de 4 motifs riches en prolines, appelés P1 à P4[8].

Rôles et fonctions de la protéine PTPN22

La protéine PTPN22 ou LYP est localisée principalement dans le cytosol des cellules immunitaires, où elle est impliquée dans de nombreuses voies de signalisation associées à la réponse immunitaire. Son action se situe principalement au niveau des voies de signalisation des récepteurs des lymphocytes T (TCR) et lymphocytes B (BCR) où elle joue un rôle important d’inhibiteur de l'activation et de la prolifération lymphocytaire. Le rôle de LYP est principalement décrit dans la signalisation du TCR[9].

En médecine

Cette phosphatase joue un rôle de régulateur négatif de l'activation des lymphocytes T à travers une inhibition de la voie de signalisation de leur récepteur, le TCR. Une mutation au sein du gène PTPN22 a été associée à diverses maladies auto-immunes dont le diabète de type 1[10] et la polyarthrite rhumatoïde[11].

La protéine est surexprimée dans le syndrome coronarien aigu entraînant une baisse des lymphocytes T régulateurs[12].

Notes et références

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000134242 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027843 - Ensembl, May 2017
3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
5. Cohen S, Dadi H, Shaoul E, Sharfe N, Roifman CM, Cloning and characterization of a lymphoid-specific, inducible human protein tyrosine phosphatase, Lyp, Blood, 1999;15;2013-24
6. Wang S, Dong H, Han J et al. Identification of a variant form of tyrosine phosphatase LYP, BMC Mol Biol, 2010;11:78
7. Chang HH, Tai TS, Lu B et al. PTPN22.6, a dominant negative isoform of PTPN22 and potential biomarker of rheumatoid arthritis, PLoS One, 2012;7:e33067
8. Burn GL, Svensson L, Sanchez-Blanco C, Saini M, Cope AP, Why is PTPN22 a good candidate susceptibility gene for autoimmune disease?, FEBS Lett, 2011;585:3689-98
9. Bottini N, Peterson EJ, Tyrosine phosphatase PTPN22: multifunctional regulator of immune signaling, development, and disease, Annu Rev Immunol, 2014;32:83-119
10. Bottini N, Musumeci L, Alonso A et al. A functional variant of lymphoid tyrosine phosphatase is associated with type I diabetes, Nat Genet, 2004;36:337-8
11. van Oene M1, Wintle RF, Liu X et al. Association of the lymphoid tyrosine phosphatase R620W variant with rheumatoid arthritis, but not Crohn's disease, in Canadian populations, Arthritis Rheum, 2005;52:1993-8
12. Flego D, Severino A, Trotta F et al. Increased PTPN22 expression and defective CREB activation impair regulatory T-cell differentiation in non-ST-segment elevation acute coronary syndromes, J Am Coll Cardiol, 2015;65:1175–1186