D'importants vestiges d'une cité lacustre, ainsi qu'une collection d'objets, outils, armes, vêtements, chaussures, en bois, tissus, cuir, et poterie, remarquablement préservés par les sédiments du lac, ont été découverts sur le site.
Les vestiges archéologiques sont rassemblés au musée d’archéologie du Jura de Lons-le-Saunier (avec ceux du Grand Lac de Clairvaux, à 20 km au sud-ouest). On relève en particulier une pirogue de 9,35 m, creusée dans un tronc de chêne, parfaitement conservée dans les marnes de la rive du lac.
Anne-Marie et Pierre Pétrequin, Le Néolithique des lacs. Préhistoire des lacs de Chalain et de Clairvaux (4000-2000 av. J.-C.), Paris, Errance, 1988, 288 p. (ISBN978-2-903442-77-4)