À partir de 1993, il est conseiller culturel et de coopération à l'Ambassade de France en Israël. En 1997, il est nommé à la direction générale des relations culturelles scientifiques et techniques du ministère des Affaires étrangères où il est à la tête de la sous-direction des sciences sociales, humaines et de l'archéologie[2].
Jean-Claude Jacq est l'auteur de nombreux articles (La Quinzaine littéraire, Le Monde diplomatique ou dans la revue Levant (créée en 1988)[7], allocutions et discours (notamment lors des colloques de l'Alliance française tenus chaque année en janvier). Il est, sous le nom de Vincent Jacq, l'auteur ou coauteur des livres suivants :