Il s'est marié à Lille le avec Henriette Bayard. Ils ont eu cinq enfants. L'ainé, Henri Maillard (1884-1949)[2] devient architecte avec son père.
Il a dessiné et construit un très grand nombre d'hôtels, immeubles, maisons, églises dont une quinzaine a été classée au titre des monuments historiques. Il a également construit les deux ailes (la chapelle et l'ensemble atrium-aula), rue Vauban à Lille, du palais académique de l'université catholique de Lille[3].
Au tout début du XXe siècle, il fut l'architecte de la station balnéaire de Wissant. Émile Seguard et Jean-Baptiste Maillard créent la société immobilière de Wissant, au capital de 500 000 francs, et achètent à la commune vingt-trois hectares de terrain. Jean Baptiste Maillard met en place un cahier des charges qui réglemente l'organisation de la station[4],[5].
Il devint membre de la société des architectes du Nord en 1888.
Réalisations notables à Tourcoing
1887-1892 : théâtre[6], acheté par la ville en 1902
1896 : hôtel Lorthiois-Leurent[7], 72 rue de Lille
1898 : maison de l'architecte[8], 54-56 rue Nationale
↑Marie-Josèphe Lussien-Maisonneuve, « Contagion néo-gothique et urbanisme dans les villes septentrionales au XIXe siècle », Revue du Nord, , p. 629-641 (lire en ligne)
↑Sophie Cueille, « Les stratégies des investisseurs : des bords de ville aux bords de mer », In situ Revue des patrimoines, (lire en ligne)