Le 11 juillet 2023, il est démis de ses fonctions à la suite de critiques publiques du haut commandement[4]. Le major-général Popov explique dans une vidéo les raisons de son remplacement : il se serait plaint auprès de l'État-major général de la faiblesse des tirs de contre-batterie russes, du manque de radars de contrebatterie et des pertes dues à l'artillerie ukrainienne. Selon lui, son renvoi est un « coup dans le dos, décapitant perfidement et vilement l'armée au moment le plus difficile »[5].
Le , Ivan Popov est arrêté pour une fraude présumée de 1 200 000 €. Le Monde estime probable que ce général était trop populaire pour ses propos concernant la mauvaise organisation de l'armée, ce qui lui a valu les foudres du Kremlin[6],[7].