Inquisición est formé en juin 1993, lorsque Manolo Schafler, alors membre du groupe Torturer, décide de former officiellement son projet de heavy metal ; il décide de contacter le batteur Carlos Hernández avec qui il répète depuis 1992. À la fin de 1993, Santa Inquisición (nom d'origine) fait participer Gonzalo Ruiz Tagle à la basse et, après quelques concerts en trio, le groupe consolide sa formation avec l'arrivée de Freddy Alexis au chant à la mi-1994.
Au début de 1995, le nom est réduit à Inquisición. En février la même année, ils entrent en studio pour enregistrer quatre morceaux qui deviendront leur première démo.
Au second semestre de 2012, prépare les morceaux de son prochain album, annoncé pour 2013. Il a pour titre Codex Gigas et s'inspire du manuscrit homonyme[7]. Les morceaux de batterie sont enregistrés à Los Angeles, en Californie, par le batteur chilien Nico Saavedra[8].
L'album est publié au label Australis Records[9] le en formats vinyle, digipack et cassette audio. Puis la même année, le groupe ouvre pour Omen et Manilla Road[10], avec leur nouveau batteur et professeur Ignacio García de Cortázar.
