En tant que major(maggiore), il a servi dans le 17e régiment d'infanterie de la brigade de Brescia[2], et en tant que lieutenant-colonel(tenente colonnello) dans le 54e régiment d'infanterie de la brigade d'Ombrie[3]. Lorsqu'il est devenu colonel(colonnello), il a été commandant du 20e régiment d'infanterie, et a ensuite été commandant adjoint de l'École centrale de tir d'infanterie[4].
D'abord promu major-général(maggiore generale) , il devient ensuite lieutenant-général(tenente generale), occupe le poste de directeur général du personnel au ministère de la Guerre, puis prend le commandement de la division militaire territoriale d'Alexandrie le 30 septembre 1913[5].
Lorsque le royaume d'Italie entre en guerre le 24 mai 1915, il commande la 3e division, renforcée par les brigades de Ravenne et de Forlì, affectée au 2e corps d'armée de la 2e armée du général Pietro Frugoni[6]. À la tête de la grande unité, il se distingue en traversant l'Isonzo sur un pont de pontons spécialement construit sous le feu de l'ennemi[7], en occupant Plava (8 et 9 juin) et en conquérant la position forte de la cote 383 (16 juin) lors de la première bataille de l'Isonzo[8]. Ce succès conduit le général Frugoni à demander au commandant en chef de l'armée, le général Luigi Cadorna, d'être relevé de son commandement, ce qui est fait le 21 juin, date à laquelle il est transféré dans le district militaire d'Ancône[8]. Il occupe ensuite le poste de chef de la commission des promotions spéciales au Commandement suprême. L'exonération de Prelli a rendu furieux le commandant du IIe corps d'armée, le général Ezio Reisoli, qui a protesté vigoureusement auprès de Frugoni, lequel a admis que, Prelli étant plus âgé que lui, il pouvait l'influencer puisqu'il avait été son subordonné[8]. Peu après, Reisoli a également été exonéré de son commandement.
Après la fin de la guerre, il a été décoré de la croix de commandeur de l'ordre militaire de Savoie pour ses mérites[8].
Il meurt à Bologne le 16 juin 1919, son corps a d'abord été enterré dans le cimetière de la ville, ensuite déplacé en 1922, conformément à sa volonté, dans le cimetière militaire de Plava, connu depuis lors sous le nom de cimetière Prelli[8].
En 1935, S.A.R. Emanuele Filiberto, duc(a) d'Aosta et de Bologne, a été enterré dans le cimetière de la ville. Emmanuel-Philibert de Savoie, duc d'Aoste, ancien commandant de la 3e armée, fit déplacer sa dépouille mortelle de Plava à Redipuglia (frazione de la commune de Fogliano Redipuglia), enterrée dans l'un des cinq monolithes alignés au pied de l'escalier, immédiatement derrière le principal du duc. De ses mémoires, Carlo Luigi Bozzi imprima en 1938 le livre La 3ª Divisione alla conquista di Plava : dalle memorie del generale Giovanni Prelli, comandante della 3ª Divisione di fanteria (La 3e division à la conquête de Plava : d'après les mémoires du général Giovanni Prelli, commandant de la 3e division d'infanterie), publié par G. Paternolli à Gorizia.
(it) Carlo Luigi Bozzi, La 3ª Divisione alla conquista di Plava: dalle memorie del generale Giovanni Prelli, comandante della 3ª Divisione di fanteria, Gorizia, Edizioni G. Paternolli, 1938.
(it) Luigi Cadorna, La guerra alla fronte italiana. Vol. 1, Milan, Fratelli Treves editori, 1921.
(it) Luigi Cadorna, La guerra alla fronte italiana. Vol. 2, Milan, Fratelli Treves editori, 1921.
(it) Alberto Cavaciocchi, Gli italiani in guerra, Milan, Ugo Mursia Editore s.r.l., 2014.
(it) Nicolò Giacchi, Luigi Chiolini, Ugo Marchini et Antonio Drago Crimi, L'esercito italiano nella grande guerra. Vol.II Le operazioni del 1915, Rome, Istituto Poligrafico dello Stato, 1929.
(it) Anna Guarducci, Trame nello spazio. Quaderni di geografia storica e quantitativa, Borgo San Lorenzo, Edizioni All'Insegna del Giglio s.a.s., 2006.
(it) Mario Muccini, Ed ora andiamo! Il romanzo di uno scalcinato, Bergame, Tavecchi Editore, 1938.
Périodiques
(it) Sergio Pelagalli, Esoneri dal comando nella Grande Guerra, dans la revue Storia Militare, n.215, Parma, Ermanno Albertelli Editore, août 2011, pp. 17-23, (ISSN1122-5289).
(it) Sergio Spagnolo, La chiesetta di San Luigi a Plava (PDF), dans la revue Alpinismo goriziano, n. 2, Gorizia, Sezione di Gorizia del Club Alpino Italiano, mai-août 2016, p. 12.