La station « Croix-Paquet » est mise en service le 12 avril 1891, en tant que station inférieure de la ligne du funiculaire de Croix-Paquet et le restera jusqu'à la fermeture de la ligne le 3 juillet 1972[1],[2].
Elle rouvre le après la transformation de l'ancienne « ficelle » en chemin de fer à crémaillère, et est accolé aux ateliers d'origine de la ligne, placés dans le jardin jusqu'à la construction de ceux d'Hénon en 1984 lors du prolongement de la ligne à la station Cuire[1]. La station doit son nom à la place Croix-Paquet qui tire elle-même son nom d'un certain Jean Pâquet, négociant, qui « a fait ériger sa croix en 1628 en remplacement d'une autre, peut-être la croix du Griffon qui avait été abattue au moment des guerres de Religion »[3].
À l'origine, la station aurait dû disparaître avec le prolongement à Hôtel de Ville - Louis Pradel le car trop proche de cette dernière et située en plein dans une pente de 17,4 %. La station rouvre le 15 septembre suivant à la suite des plaintes des riverains et est équipée de quais de taille réduite construits de façon provisoire puis reconstruits en 1984, le déménagement des ateliers permettant d'agrandir la station pour recevoir le nouveau matériel à deux caisses[1].
Il n'y a pas de personnel, des automates permettent l'achat et d'autres le compostage des billets.
La station n'est pas équipée d'ascenseurs pour l'accès aux personnes à mobilité réduite à cause de son placement au fond d'une tranchée ouverte et de l'étroitesse des quais, elle est l'unique station non accessible du réseau. Elle est dotée de portillon d'accès depuis le [1].
La station basse du funiculaire
La station en 1982, avec la voie d'accès aux ateliers
Outre les rues et places avoisinantes, elle permet de rejoindre à pied différents sites, notamment : les pentes de la Croix-Rousse, la résidence internationale de Lyon et les théâtres Espace 44 et Théâtre de la Platte.