29 arbitres (15 centraux et 14 assistants) sont présélectionnés pour la compétition. Ils participent à un stage au Maroc du 31 mars au 4 avril 2019 où ils subissent une série de tests avant d'être retenus définitivement. Pour la première fois, des femmes sont retenues pour arbitrer une compétition masculine de la CAF. Il s'agit de la tanzanienne Jonesia Rukyaa Kabakama et des assistantes kényane Mary Wanjiru Njoroge et malgache Lidwine Rakotozafinoro[2].
Les qualifications regroupent 49 équipes réparties en six zones géographiques. Il y a une équipe qualifiée par zone, à l'exception de la zone A de l'Afrique de l'Ouest à laquelle appartient le Mali, tenant du titre, et qui a deux équipes qualifiées. De plus, la Tanzanie est qualifiée automatiquement en tant que pays organisateur.
Dans chaque zone est organisé un tournoi constitué d'un tour de poules puis de matchs à élimination directe.
Le tirage au sort est organisé le 20 décembre 2018 au Mlimani City Conference Centre de Dar es Salam[4]. Les deux têtes de série du tirage sont la Tanzanie (pays hôte) et la Guinée (meilleure performance lors de l'édition précédente). Les autres sélections sont répartis en deux pots : l'Angola et le Cameroun dans le pot 1 (tous deux qualifiés en 2017) et les autres dans le pot 2[5].
En juillet 2016, Total a annoncé avoir passé un accord de sponsoring avec la Confédération Africaine de Football (CAF)[9]. L’accord vaut pour les huit prochaines années et concernera les dix principales compétitions organisées par la CAF, dont la Coupe d’Afrique des Nations U-17, qui est désormais baptisée "Coupe d’Afrique des Nations U-17 Total".