La Coupe CECAFA des nations 2003 est la vingt-septième édition de la Coupe CECAFA des nations qui a eu lieu au Soudan du 30 novembre au . Les nations membres de la CECAFA (Confédération d'Afrique centrale et de l'Est) sont invitées à participer à la compétition.
C'est l'Ouganda qui remporte la compétition en s'imposant en finale face à l'équipe du Rwanda. Le Kenya, tenant du titre, se classe quant à lui troisième. C'est le neuvième titre de champion de la CECAFA pour la sélection ougandaise.
Cette édition doit faire face à de nombreuses défections et forfaits de dernière minute. Avant le tirage au sort, les sélections du Burundi, de Djibouti et de Somalie se retirent, évoquant des raisons financières. Ensuite, après le tirage au sort, ce sont les équipes de Tanzanie et d'Éthiopie qui déclarent forfait, cette dernière pour raisons diplomatiques, le tirage l'ayant placé dans la même poule que l'Érythrée (les deux pays entretiennent des relations extrêmement tendues depuis la guerre qui les a opposées entre 1998 et 2000).