Ce bâtiment de 185 m de long et 15 m de haut, d'une superficie de 11 390 m2 répartis sur trois étages, se situe au bord du centre ville historique (la Boucle) et du Faubourg de Rivotte, au pied de la citadelle de Besançon. Il est bâti sur le site de deux hectares de l'ancien port fluvial de Besançon, des années 1930, le long du Doubs, à proximité du pont de Bregille, pour un coût total estimé à 46,6 millions d'euros.
Intégration des bâtiments en brique, de l'ancien port fluvial
Façades en damier en bois, verre et aluminium
Toiture pixelisée de 5 600 m2, mêlant panneaux de verre, aluminium teinté, et 1 300 m2 de panneaux photovoltaïques
Les espaces dédiés au conservatoire comprennent un auditorium de 290 places, dont un plateau d'une surface de 230 m², et 80 salles d'enseignement (dont trois de plus de 60 m², et quatre dépassant les 140 m²).
Une collection croissante acquise par le FRAC, de plus de 500 œuvres d'art contemporain en 2012, de plus de 200 artistes, de peinture, photographie, sculpture, installation, œuvre graphique, œuvre textile, œuvre audiovisuelle..., avec pour ligne directrice la question du temps (mémoire, durée...), le tout exposées partiellement dans de nombreuses salles d'expositions, dont deux de 490 et 100 m².