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Les coureurs ayant quitté Colmar rallieront Besançon par le sud du Haut-Rhin où se dérouleront deux premiers sprints intermédiaires à Pulversheim et Dannemarie. Ils parcoureront ensuite le Territoire de Belfort en gravissant la première côte de 3e catégorie à Lebetain. S'ensuit l'entrée dans le Doubs avec une deuxième côte de 3e catégorie à Blamont puis la descente sur Besançon par la vallée du Doubs avec un dernier sprint intermédiaire à Baume-les-Dames à un peu moins de 40 km de l'arrivée à Besançon devant Micropolis.
Récit
À 45 km de l'arrivée, les coureurs de l'équipe AG2R décident de se lancer à la poursuite des échappés pour protéger le maillot jaune de Rinaldo Nocentini menacé par l'avance de George Hincapie qui était à 5 min 25 s du leader au début de l'étape. Ce dernier développe d'importants efforts pour préserver l'avance des hommes de tête.
À 10 km de l'arrivée, Sergueï Ivanov contre deux attaques de Hayden Roulston (Cervélo) et de Christophe Le Mével (La Française des jeux) en filant sur la droite et parvenant à prendre une vingtaine de secondes d'avance. Déterminé à gagner, il concrétise son avance sur les autres échappés et remporte l'étape.
À l'arrivée du peloton, Mark Cavendish serre Thor Hushovd dans les barrières et se retrouve déclassé à la 154e place. Il a désormais 18 points de retard sur Hushovd pour le maillot vert.
En marge de la course, une spectatrice est décédée et deux autres blessés des suites d'une collision avec une moto de la garde républicaine entre le passage des échappés et du peloton à Wittelsheim.
Sprints intermédiaires
1. Sprint intermédiaire de Pulversheim (kilomètre 34)
En , le Tribunal du Sport annule tous les résultats obtenus par Pellizotti sur ce Tour, en raison de données anormales constatées sur son passeport biologique[1].