L'église a été fondée par les bénédictins au XIIIe siècle et était à l'origine dédiée à saint Fortunat (San Fortunato) ; plus tard, l'église et le couvent passèrent aux franciscains.
Le couvent est supprimé au début du XIXe siècle et l'église est abandonnée. Elle a été rouverte au culte en 1903 et le complexe monastique a été restauré et rendu aux franciscains en 1923[2].