Malancourt liegt etwa 20 Kilometer nordwestlich von Verdun. Umgeben wird Malancourt von den Nachbargemeinden Cuisy im Norden, Béthincourt im Nordosten und Osten, Esnes-en-Argonne im Südosten und Süden, Avocourt im Süden und Südwesten sowie Montfaucon-d’Argonne im Westen und Nordwesten.