Hans von Hebra wurde 1870 zum Doktor der Medizin promoviert. Dem Vorbild seines Vaters folgend, wandte er sich den Spezialfächern für Dermatologie und Syphilis zu und trat zunächst in das Wiener Allgemeine Krankenhaus ein. 1876 besuchte er verschiedene Kliniken im Ausland. In der Folge war er als Privatdozent an der Universität Wien tätig, wo er seine Vorlesungen in deutscher, französischer und englischer Sprache hielt. 1883 wurde Hebra Vorstand der Abteilung für Hautkrankheiten und Syphilis an der Allgemeinen Poliklinik Wien. Bei der Erbauung der neuen Klinik erwarb er sich große Verdienste. Darauf folgte die Ernennung zum Primararzt des Wiedner Krankenhauses.
Hebra veröffentlichte zahlreiche Aufsätze in Fachzeitschriften und mehrere selbständige medizinische Werke, darunter ein Kurzgefasstes Lehrbuch über Hautkrankheiten. In der Mitte der Neunziger-Jahre wurde er in den Gemeinderat der Stadt Wien gewählt.