Am 7. Dezember 1989 wurde er zum Bischof von La Spezia-Sarzana-Brugnato ernannt. Er war zudem Vorsitzender des Verwaltungsrats der Zeitschrift Avvenire.[1] 1995 wurde Sanguineti in der Italienischen Bischofskonferenz Präsident der Kommission für Kultur und Massenmedien, was er bis 2000 blieb. Am 19. Dezember 1998 wurde er zum Bischof von Brescia ernannt.
Am 19. Juli 2007 nahm Papst Benedikt XVI. sein altersbedingtes Rücktrittsgesuch an.