Friedrich Jäger studierte Medizin in Würzburg, Wien und Landshut und wurde 1808 in Landshut und nochmals 1812 an der Universität Wienpromoviert. Dort wurde er 1813 Assistent des Ophthalmologen Georg Joseph Beer.
Andreas Mettenleiter: Was Friedrich Jäger von Jaxtthal (1784–1871) als junger Medizinstudent 1804/05 in Würzburg erlebte. Auszüge aus den 1864 entstandenen Memoiren des bekannten Augenarztes. In: Tempora mutantur et nos? Festschrift für Walter M. Brod zum 95. Geburtstag. Mit Beiträgen von Freunden, Weggefährten und Zeitgenossen. Hrsg. von Andreas Mettenleiter, Akamedon, Pfaffenhofen 2007 (= Aus Würzburgs Stadt- und Universitätsgeschichte, 2), ISBN 3-940072-01-X, S. 192–194.
Gabriela Schmidt: Jäger, Friedrich. In: Werner E. Gerabek u. a. (Hrsg.): Enzyklopädie Medizingeschichte. De Gruyter, Berlin/New York 2005, ISBN 3-11-015714-4, S. 687.
Maria Schneider: Dr. med. Friedrich Jäger von Jaxtthal (1784–1871). Augenarzt zu Wien und Leibarzt des Fürsten Metternich: Autobiographie [aus dem Jahr 1864] mit Kommentar. (Medizinische Dissertation, München 1988) Lit-Verlag, Münster 1988 (= Medizin und Gesellschaft, 4)