SV Tollensewerke Neubrandenburg und FC Neubrandenburg fusionierten nach der Saison 1998/99 zum FC Tollense Neubrandenburg. 2004 ging der 1. FC Neubrandenburg 04 aus FC Tollense Neubrandenburg hervor.
2
In der Saison 1994/95 übernahm der FC Pommern Stralsund den Ligaplatz vom TSV 1860 Stralsund.
3
1994 nannte sich der VfL 1990 Rostock in PSV Rostock um.
4
1996 ging der Rostocker FC 95 aus der Fußballabteilung des TSV Grün-Weiß Rostock hervor.
5
1997 ging der FC Anker Wismar aus einer Fusion der Fußballabteilung der TSG Wismar und dem SV Schiffahrt/Hafen Wismar hervor.
6
In der Saison 2003/04 übernahm der ESV Greifswald den Ligaplatz vom Greifswalder SC. 2004 ging der Greifswalder SV 04 aus ESV Greifswald hervor.
7
2013 entstand der FC Mecklenburg Schwerin aus einer Fusion des Föderkader FCM Schwerin und des FC Eintracht Schwerin.
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Umbenennung 2014 vom Torgelower SV Greif zum Torgelower FC Greif.
9
2015 entstand der Greifswalder FC aus dem Greifswalder SV 04 und dem FC Pommern Greifswald.
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1997/98 VfL Bergen und Polizei SV Rostock jeweils 3 Punkte Abzug.
11
1998/99 Polizei SV Rostock 6 Punkte Abzug.
12
2009/10 Greifswalder SV 04 II wurde nach der Hinrunde insolvenzbedingt vom Spielbetrieb zurückgezogen. Die Punktewertungen der Spiele der Hinrunde blieben laut fussball.de gültig.
13
2011/12 Rostocker FC und TSV Graal-Müritz jeweils 3 Punkte Abzug.
14
2012/13 Der Schweriner SC wurde nach der Hinrunde vom Spielbetrieb zurückgezogen. Die Punktewertungen der Hinrundenspiele wurden laut fussball.de annulliert, die Torwertung blieb für die Gegner gültig.
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2014/15 Der FSV Bentwisch wurde nach der Hinrunde vom Spielbetrieb zurückgezogen. Die Punktewertungen der Hinrundenspiele wurden laut fussball.de annulliert, die Torwertung blieb für die Gegner gültig.
16
2015/16 zog der Sievershäger SV seine Mannschaft aus personellen Gründen noch vor Saisonbeginn aus der Verbandsliga zurück.
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2001 ging der FV Lok Anklam in den VFC Anklam über.
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2015/16 VFC Anklam 3 Punkte Abzug.
19
2016/17 zog die TSG Neustrelitz II seine Mannschaft aus personellen Gründen noch vor Saisonbeginn aus der Verbandsliga zurück.
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1993 fusionierte der ESV Lok Pasewalk mit dem SV Rollwitz 1968 zum Pasewalker FV.
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2018 schlossen sich die Mannschaften des FC Pommern Stralsund und des Stralsunder FC dem TSV 1860 Stralsund an.
22
2010/11 übernahm der FC Pommern Greifswald den Startplatz vom HSG Uni Greifswald.
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Ab 2010/11 trat Vorwärts Drögeheide als Torgelower SV Greif II an.
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2022/23 FSV Bentwisch 3 Punkte Abzug.
25
2023 fusionierte der FSV Einheit Ueckermünde mit dem Torgelower FC Greif zur SpVgg Torgelow-Ueckermünde.