Dinodnavirus

Dinodnavirus
FE-SEM-Aufnahmen von HcDNAV-Teilchen, Heterocapsa circularisquama infizierend
Systematik
Klassifikation: Viren Realm: Varidnaviria?[1] Reich: Bamfordvirae?[1] Phylum: Nucleocytoviricota?[1] Klasse: Pokkesviricetes?[1] Ordnung: Asfuvirales?[1] Familie: nicht klassifiziert Gattung: Dinodnavirus Art: Heterocapsa circularisquama DNA virus 01
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA Baltimore: Gruppe 1
Wissenschaftlicher Name
Dinodnavirus
Kurzbezeichnung
HcDNAV (Spezies)
Links
NCBI Taxonomy: 1232647 (Genus), 650121 (Spezies) ViralZone (Expasy, SIB): 3136 (Genus)

Weitere FE-SEM-Aufnahmen von HcDNAV-Virionen und virusinfizierten Zellen von Heterocapsa circularisquama. (K) Eine lysierte ganze Zelle von H. circularisquama. Sichtbar sind die Organellen (o) des Zytoplamas als auch die Viroplasmen (v). (L) Höhere Vergrößerung des weiß umrandeten Bereichs in (K), der Virionen im Viroplasma zeigt. Viele Viruspartikel haben keine exakt ikosaedrische Formen, sondern sind mit dem Vorsprung bei dem sich bildenden Scheitelpunkt (Vertex) ausgestattet. Außerdem sind faserige Materialien (Pfeilspitzen) vorhanden. (M) Höhere Vergrößerung des gestrichelt umrandeten Bereichs in (K), eine Nahaufnahme unreifer Virionen im Viroplasma zeigend. Abkürzungen: m − von der Wirtszelle ausgeschiedener Schleim, o – zytoplasmatische Organellen, s – Körperschuppen (englisch body scales) der Wirtszelle, charakteristisch für H. circularisquama, v – Viroplasma.

Dinodnavirus ist eine Gattung der Viren, deren Mitglieder Dinoflagellaten infizieren.[2] Die Gattung ist mit Stand April 2019 nicht klassifiziert[1]. Es handelt sich möglicherweise um Vertreter des Phylums Nucleocytoviricota (früher Nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDV) mit Riesen- und Pockenviren. Der Name ist von dino für Dinoflagellat und DNA abgeleitet. Die (monotypische) Typ-Spezies ist das Heterocapsa circularisquama DNA virus 01 (HcDNAV, früher HcV).[3]

Virologie

Das Virus besitzt ein icosahedrales Kapsid mit etwa 200 nm Durchmesser. Sein Genom besteht aus einer ds-DNA von einer Größe von ca. 356 kb. Das Virus infiziert das Dinoflagellatum Heterocapsa circularisquama (Dinoflagellaten: Peridiniales). Während der Replikation entstehen Virionen aus einem Teil des Zytoplasmas, dem sogenannten Viroplasma, das vom Virus erzeugt wird.[4]

Taxonomie

Es gibt derzeit noch keine vom ICTV bestätigte Einordnung dieser Gattung (Stand April 2020). Die Typ-Spezies wurde ursprünglich der Familie Phycodnaviridae (heute in der Ordnung: Algavirales, Klasse Megaviricetes innerhalb der NCLDV) zugeordnet. Untersuchungen des Genoms der Dinodnaviren haben aber gezeigt, dass die Gattung eher zur Familie Asfarviridae (heute in der Ordnung Asfuvirales, Klasse Pokkesviricetes) gehört,[5] ähnlich wie die vorgeschlagenen Taxa „Faustovirus“, „Pacmanvirus“ und „Kaumoebavirus“. Näheres siehe „Faustovirus“ §Äußere Systematik.

Weblinks

• Yoshihito Takano, Yuji Tomaru, Keizo Nagasaki: Visualization of a Dinoflagellate-Infecting Virus HcDNAV and Its Infection Process, in: Viruses 10, 554, 11. Oktober 2018, doi:10.3390/v10100554, PDF (via MDPI Open Access CC BY 4.0)

Einzelnachweise

1. ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1 (Memento des Originals vom 2. August 2022 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
2. K. Tarutani, K. Nagasaki, S. Itakura, M. Yamaguchi: Isolation of a virus infecting the novel shellfish-killing dinoflagellate Heterocapsa circularisquama. In: Aquat Microb Ecol. 23, 2001, S. 103–111.
3. Mohammadreza Sadeghi, Yuji Tomaru, Tero Ahola: RNA Viruses in Aquatic Unicellular Eukaryotes, in: MDPI Viruses, Band 13, Nr. 3, Special Issue Viruses of Microbes 2020: The Latest Conquests on Viruses of Microbes, 362;doi:10.3390/v13030362
4. K. Nagasaki, Y. Tomaru, K. Tarutani, N. Katanozaka, S. Yamanaka, H. Tanabe, M. Yamaguchi: Growth characteristics and intraspecies host specificity of a large virus infecting the dinoflagellate Heterocapsa circularisquama. In: Applied and Environmental Microbiology. Band 69, Nummer 5, Mai 2003, S. 2580–2586, doi:10.1128/aem.69.5.2580-2586.2003, PMID 12732524, PMC 154496 (freier Volltext).
5. H. Ogata, K. Toyoda, Y. Tomaru, N. Nakayama, Y. Shirai, J. M. Claverie, K. Nagasaki: Remarkable sequence similarity between the dinoflagellate-infecting marine girus and the terrestrial pathogen African swine fever virus. In: Virol J. 6, 2009, S. 178.