Das Orchester wurde 1980 von Musikern ins Leben gerufen, wobei die neu gegründete Auckland Philharmonia Society Inc als Rechtsträger diente. 25 Jahre lang war diese Gesellschaft für die künstlerische Leitung verantwortlich, während Angelegenheit des Managements und der Finanzen von einem Beirat übernommen wurden. Im Jahre 2005 erfolgte ein grundlegender Strukturwandel, in dessen Folge nun die Auckland Philharmonia Foundation und die Society gemeinsam die Geschicke des Orchesters leiten.[1] Dabei bleibt die Society für künstlerische und die Foundation für finanzielle Belange zuständig.
Das Auckland Philharmonia Orchestra führt, neben der Kooperation mit der New Zealand Opera sowie des Royal New Zealand Ballet, über 50 Konzerte jährlich auf. Zudem ist es in Zusammenarbeit mit dem neuseeländischen Ministerium für Kultur im Bereich der musikalischen Nachwuchsförderung tätig. Seit 2016 steht es unter der Leitung von Giordano Bellincampi, der diese Position von Eckehard Stier übernahm, der am APO von 2009 bis 2015 tätig war. Vorherige musikalische Direktoren waren unter anderem John Hopkins und Miguel Harth-Bedoya.