Pada masa kabinet Dwikora, Wilujo menjabat sebagai Gubernur Lembaga Ketahanan Nasional (Lemhanas). Ia wafat pada tahun 1968.
Salah satu cucu Wiluyo Puspoyudo yang saat ini menjadi tokoh nasional adalah Emil Elestianto Dardak, wakil gubernur Jawa Timur 2019-2024 yang juga juru bicara calon wakil Presiden Gibran Rakabuming Raka pada Pilpres 2024.
Wiluyo Puspoyudo yang meninggal pada 1968 dahulu disebut merupakan perwira militer pertama yang mendarat di Kota Balikpapan semasa perang kemerdekaan.
Dia diyakini memiliki andil dalam menggagalkan pembantaian yang direncanakan oleh Belanda di Kaltim ketika menjabat menjadi Komandan Brigade E di Kaltim sejak 1945.
Putranya, Winarso, bekerja di Pertamina dan cucunya, Mutiara Tjahjaningrum, menikah dengan Timbul Surjatin dan ikut bersama suaminya ke Malaysia dimana suaminya kerja di Petronas. Wiluyo meminta kepada para keturunannya agar tak masuk TNI karena "Indonesia sudah merdeka".[3]
Djamily, Mizwar (1986). Mengenal Kabinet RI Selama 40 Tahun Indonesia Merdeka [Indonesian Cabinet for 40 Years of the Independence of Indonesia] (dalam bahasa Indonesia). Jakarta: PT. Kreasi Jaya Utama.Pemeliharaan CS1: Bahasa yang tidak diketahui (link)