Semula perebutan tempat babak ketiga diumumkan dengan sepuluh tim (peringkat ke-2 hingga ke-10 pada peringkat tim yang kalah babak pertama dan Kepulauan Mariana Utara) akan diundi untuk memainkan dua pertandingan kandang-tandang untuk menentukan lima tim yang lolos ke babak ketiga.[2][3] Namun, Guam dan Kepulauan Mariana Utara tidak diikutkan pada pengundian perebutan tempat babak ketiga pada 1 Mei 2024. Dengan demikian, tiga besar peringkat tim yang kalah (Bhutan, Maladewa, dan Laos) lolos langsung ke babak ketiga, sementara enam tim tersisa masuk perebutan tempat babak ketiga.[4] Seluruh pemenang perebutan tempat babak ketiga bergabung dengan 21 tim lain (tiga besar peringkat tim yang kalah pada babak pertama dan 18 tim dari babak kedua) yang telah lolos ke babak ketiga untuk berkompetisi memperebutkan enam tempat tersisa pada putaran final Piala Asia AFC 2027.
Tim peserta
Peringkat tim kalah terbaik
Pengundian
Pengundian perebutan tempat babak ketiga dilakukan pada 9 Mei 2024 di Kuala Lumpur, Malaysia.[4] Keenam tim dibagi dalam dua pot untuk diundi menjadi tiga pasangan pertandingan, dengan masing-masing pasangan akan memainkan pertandingan kandang dan tandang pada 5 dan 10 September 2024. Penempatan unggulan berdasarkan Peringkat Dunia FIFA per April 2024 (ditunjukkan dalam tanda kurung).
^Timor-Leste memainkan pertandingan kandang di Stadion Kapten I Wayan Dipta, di Gianyar, Indonesia, alih-alih di stadion kandang Stadion Nasional Timor Leste di Dili, yang tidak memenuhi persyaratan FIFA.