Tanggal 17 Maret2005, Hawaii Undersea Research Laboratory (HURL) mengirim Pisces IV & Pisces V ke bawah laut dan menemukan I-401 berada di lepas pantai Kalaeloa. I-401 tergeletak di kedalaman 820 meter (2.690 ft). Haluannya rusak di dekat bagian hangar pesawat. Dia terbelah dua, tetapi kedua bagian tersebut tidak berada jauh satu sama lainnya dan "terhubung" dengan barisan debris. Bahkan berada di dasar laut, badan kapalnya berada dalam posisi berdiri tegak. Tulisan "I-401" juga terlihat di dekat menara komando. Kondisi meriam anti-udara 25-mm masih terlihat dalam kondisi yang baik pula.[2]
