KEGG

KEGG
Konten
Deskripsi	Bioinformatics resource for deciphering the genome.
Organisme	All
Kontak
Pusat penelitian	Kyoto University
Laboratorium	Kanehisa Laboratories
Kutipan utama	PMID 10592173
Tanggal rilis	1995
Akses
Situs web	www.kegg.jp
URL layanan web	REST see KEGG API
Perangkat
Web	KEGG Mapper
Lain-lain

KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) adalah kumpulan database yang berkaitan dengan genom, pathway biologi, penyakit, obat, dan bahan kimia. KEGG digunakan untuk riset dan pengajaran bioinformatika, termasuk analisis data dalam genomika, metagenomika, metabolomika dan studi omika lainnya, perancangan model dan simulasi dalam sistem biologi, serta riset translational dalam pengembangan obat.

Sejarah

Proyek database KEGG dimulai pada tahun 1995 oleh Minoru Kanehisa, Professor pada Institute for Chemical Research, Kyoto University, yang saat itu berada di bawah Human Genome Program Jepang.^[1]^[2] Menurut para developernya, KEGG merupakan suatu "computer representation" dari sistem biologi.^[3]

Informasi sistem
- PATHWAY—peta pathway untuk fungsi-fungsi seluler dan organismal
- MODULE—modul atau unit fungsional gen
- BRITE—klasifikasi hierarkis entiti biologi
Informasi genomik
- GENOME—genom lengkap
- GENES—gen dan protein dalam genom lengkap
- ORTHOLOGY—group ortologi gen dalam genom lengkap
Informasi kimia
- COMPOUND, GLYCAN—senyawa kimia dan glikan
- REACTION, RPAIR, RCLASS—reaksi kimia
- ENZYME—nomenklatur enzim
Informasi kesehatan
- DISEASE—penyakit manusia
- DRUG—obat yang sudah diberi izin
- ENVIRON—obat mentah dan bahan terkait kesehatan

Lihat pula

Comparative Toxicogenomics Database - CTDintegrates KEGG pathways with toxicogenomic and disease data
ConsensusPathDB, a molecular functional interaction database, integrating information from KEGG
Gene ontology
PubMed
Uniprot
Gene Disease Database

Referensi

^ Kanehisa M, Goto S (2000). "KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes". Nucleic Acids Res. 28 (1): 27–30. doi:10.1093/nar/28.1.27. PMC 102409 . PMID 10592173.
^ Kanehisa M (1997). "A database for post-genome analysis". Trends Genet. 13 (9): 375–6. doi:10.1016/S0168-9525(97)01223-7. PMID 9287494.
^ Kanehisa M, Goto S, Hattori M, Aoki-Kinoshita KF, Itoh M, Kawashima S, Katayama T, Araki M, Hirakawa M (2006). "From genomics to chemical genomics: new developments in KEGG". Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D354–7. doi:10.1093/nar/gkj102. PMC 1347464 . PMID 16381885.

Pranala luar

KEGG website
GenomeNet mirror site
The entry for KEGG Diarsipkan 2012-04-02 di Wayback Machine. dalam MetaBase

[pmid10592173-1] Kanehisa M, Goto S (2000). "KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes". Nucleic Acids Res. 28 (1): 27–30. doi:10.1093/nar/28.1.27. PMC 102409 . PMID 10592173.

[pmid9287494-2] Kanehisa M (1997). "A database for post-genome analysis". Trends Genet. 13 (9): 375–6. doi:10.1016/S0168-9525(97)01223-7. PMID 9287494.

[pmid16381885-3] Kanehisa M, Goto S, Hattori M, Aoki-Kinoshita KF, Itoh M, Kawashima S, Katayama T, Araki M, Hirakawa M (2006). "From genomics to chemical genomics: new developments in KEGG". Nucleic Acids Res. 34 (Database issue): D354–7. doi:10.1093/nar/gkj102. PMC 1347464 . PMID 16381885.

[1]

[2]

[3]