Agensi ini didirikan sebagai manajemen Jaejoong, Junsu, dan Yoochun (mantan anggota TVXQ) setelah ketiganya mengajukan gugatan terhadap label rekaman mereka sebelumnya, SM Entertainment. Mereka bertiga bertemu dengan Baek Chang-jou pada pertengahan 2009, tidak lama setelah mereka mengajukan gugatan tersebut. Setelah itu, C-JeS resmi didirikan. Chang-jou secara langsung mengatakan dalam wawancara bahwa C-JeS didirikan karena JYJ. Chang-jou berinvestasi besar dalam membangun grup yang baru dibentuk tersebut baik citra maupun kredibilitas JYJ setelah industri hiburan Korea menutup pintu untuk mereka bertiga karena dianggap sebagai "pemberontak" menentang label mereka sebelumnya.[1][2]
Pada 8 Maret 2013, aktor Lee Jung-jae bergabung dalam C-JeS Entertainment. Dia diketahui memilih C-Jes setelah bekerja dengan Song Ji-hyo di film New World.[3]
Pada 29 Agustus 2014, C-JeS Entertainment menandatangani kontrak dengan aktris sekaligus penyanyi Hwang Jung-eum.[4][5][6]
Pada 10 Juli 2015, Song Ji-hyo mengakhiri kontraknya dengan C-JeS Entertainment setelah 4 tahun.[7]
^박소현 (July 10, 2015). 송지효, FA 됐다…씨제스 엔터와 매니지먼트 업무 종료. Xports News (dalam bahasa Korea). Diarsipkan dari versi asli tanggal 2015-07-11. Diakses tanggal 10 July 2015.