真核生物mRNA轉錄的轉錄前起始複合體示意圖
轉錄前起始複合體 (Transcription preinitiation complex,簡稱PIC )是真核生物 與古菌 細胞基因轉錄 前由約100個蛋白質 組成的複合體,真核生物轉錄mRNA 的前起始複合體包括負責轉錄的RNA聚合酶Ⅱ [ 1] [ 2] 、6種通用轉錄因子 (TFIIA 、TFIIB 、TFIID 、TFIIE 、TFIIF 、TFIIH )與其他輔助蛋白,組成過程中TFIID的TATA結合蛋白 次單元首先在TFIIA的幫助下與DNA啟動子 的TATA盒 (或起始子元件 等其他元件)結合[ 3] ,接著TFIIB也會與啟動子上的BRE元件(TFIIB-recognition element)結合[ 4] ,D、A、B三者與啟動子結合組成的複合體可再吸引TFIIF和RNA聚合酶Ⅱ前來[ 3] ,隨後TFIIE、TFIIH再先後與複合體結合[ 5] ,後者結合DNA中的模板股,具解旋酶 活性,可將啟動子區域的DNA雙股螺旋解開以形成轉錄泡 ,此外還具激酶 活性,可將RNA聚合酶Ⅱ的C端 結構域磷酸化 以活化聚合酶開始轉錄[ 5] 。除了以上六種通用轉錄因子外,轉錄前起始複合體還包括中介體 、染色質重塑酶 、其他共同活化物 等調控蛋白[ 6] ,其中中介子與轉錄前起始複合體結合後,可與距離較遠的調控序列強化子 結合以促進轉錄進行[ 7] 。古菌的轉錄前起始複合體與真核生物的類似,但較為簡化,僅需TATA結合蛋白、TFIIB 與RNA聚合酶,且轉錄因子與DNA結合的方向和真核生物的可能為相反[ 8] 。
真核生物的轉錄起始後,聚合酶合成約10個鹼基的RNA時可能發生流产性起始 ,即聚合酶停止轉錄、將此10nt左右的RNA釋出,但仍與啟動子結合,隨後聚合酶成功脫離啟動子和轉錄前起始複合體(啟動子解離)才可繼續轉錄產生完整的mRNA(此過程中RNA聚合酶Ⅱ的C端結構域會被磷酸化[ 9] )[ 10] ,在此之前可能會發生數次的流产性起始[ 11] 。
RNA聚合酶I (轉錄rRNA )與RNA聚合酶III (轉錄tRNA 等小RNA)轉錄起始的機制則與RNA聚合酶II的不同。RNA聚合酶I轉錄前,UBTF 先與起始位點上游100至200nt處的上游控制元件(UCE)結合,再與選擇因子I 複合體(或稱TIF-IB)結合,促使上游控制元件與啟動子核心區域接觸,隨後RNA聚合酶I再與此複合體結合並開始轉錄[ 12] [ 13] ;RNA聚合酶III的轉錄起始則仰賴位於起始位點下游的調控序列(internal control sequences),具體機制因轉錄小RNA的種類而異[ 14] 。
參考文獻
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