2006 у Миколаєві — список важливих подій, що відбулись у 2006 році в Миколаєві. Також подано перелік відомих осіб, пов'язаних з містом, що померли цього року. З часом буде додано відомих миколаївців, що народилися у 2006 році.
У Миколаєві відбувся перший міжнародний відкритий театральний конкурс, фестиваль «Homo Ludens».
Заснована Чорноморська яхтова верф — суднобудівне підприємство, що спеціалізується на будівництві вітрильних і моторних яхт за індивідуальними проєктами.
Меншиков Валентин Петрович — ветеран праці, депутат Миколаївської міської ради відзначений грамотами Держбуду України за сприяння підвищенню якості будівництва об'єктів в місті Миколаєві.
Волохов Євген Павлович — депутат Миколаївської міської ради, заслужений лікар Української РСР, визнаний кращим серед працівників закладів охорони здоров'я Миколаївської області в номінації «За новітні технології в пологовій допомозі» та в номінації «Здорова мати — здорова дитина».