Народився 28 грудня1996 року в місті Лонжумо. Розпочав займатись футболом в академіях невеличких клубів, поки у віці 14 років не потрапив в академію «Генгама». У академії цього клубу перебував протягом трьох сезонів, але клуб не запропонував йому професійний контракту в кінці навчання. В результаті Ндомбеле провів лише один матч за дублюючу команду клубу.
Влітку 2014 року перейшов у «Ам'єн», але протягом перших двох сезонів також виступав виключно за дублерів команди з Ам'єна. 9 серпня 2016 року дебютував за першу команду у матчі Кубка ліги, а у жовтні 2016 року підписав свій перший у кар'єрі професійний контракт. В цьому ж сезоні 2016/17 дебютував за клуб у чемпіонаті, зігравши 30 матчів у Лізі 2 і допомігши команді вийти в еліту.
На початку сезону 2017/18 дебютував з клубом у Лізі 1, зігравши 3 матча, проте ще до закриття трансферного вікна 31 серпня 2017 року на правах оренди перейшов в «Ліон», орендна угода розрахована на 1 рік з подальшим правом викупу[2]. Дебютував за новий клуб 17 вересня в матчі проти «Парі Сен-Жермен»[3]. Станом на 7 травня 2018 року відіграв за команду з Ліона 30 матчів в національному чемпіонаті.
Влітку 2019 року Тангі Ндомбеле став футболістом «Тоттенгем Готспур»[4]. Відіграв за лондонців наступні два з половиною сезони, після чого на другу половину сезону 2021/22 був відданий в оренду до свого попереднього клубу, «Ліона».