Район був утворений 1928 року як Джаркентський, з 1942 року назву змінено на сучасну. У період 1989-1999 років до складу Кербулацького району була передана частина території Панфіловського району (Басшийський сільський округ).
Склад
До складу району входять 13 сільських округів та 1 міська адміністрація: