Назва озера походить від невеликого острова, нині півострова Маркен, розташованого у південно-західній частині озера. Півострів відгороджує від озера затоку Гаувзе. У північно-західній частині озера у міста Горн розташована затока Горнс-Гоп. Південно-західна частина озера має називу Еймер — раніше в тому місці в Зейдерзе впадала річка Ей.
В рамках проекту «Зейдерзе» після будівництва дамби Афслютдейк, що перетворила затоку Північного моря в прісноводне озеро, почалося активне осушення земель. У тому числі на місці Маркермер планувалося створити польдерМаркервард[en]. Але після завершення будівництва дамби Гаутрібдеїк в 1976 році з'явилися питання про фінансову раціональності осушення озера, і в 1980-х роках роботи були зупинені на невизначений термін. З тих пір озеро має власну екологічну та рекреаційну цінність — Маркермер використовують як прісноводне водосховище, що згладжує коливання води в періоди високої води і посух. У посуху 2003 року воду з Маркермер використовували для підтримки рівня води в каналах Амстердама.
Посилання
Вікісховище має мультимедійні дані за темою: Маркермер
Markermeer. www.rijkswaterstaat.nl(нід.). Процитовано 5 грудня 2019.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)